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请问全外显子测序和全基因检测的区别?

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51758 6 sunshinesun 发表于 2016-2-12 22:04:12 |

6条精彩回复,最后回复于 2016-3-30 16:53

近在身边的爱  小学六年级 发表于 2016-2-13 17:27:17 | 显示全部楼层 来自: 上海
本帖最后由 近在身边的爱 于 2016-2-13 17:28 编辑

全基因检测就是把整个基因,包括外显子、内含子及基因上下游都检测了。而外显子是基因最关键的部分。现在如果在外面公司用高通量测序,应该是整个基因都可以测到。但是由于目前的靶向性药物针对是单位点突变或基因融合(主要是外显子),因此测外显子或测全基因差别不大。一般公司会将相应基因的所有位点信息,都报告给你。至于费用,应该差别不大。 我所知道的是有公司测所有肺癌靶向药物的基因,所有位点,大概一万多人民币。
妈妈长寿  博士二年级 发表于 2016-2-13 18:27:21 | 显示全部楼层 来自: 广东广州
感谢二楼分享
sunshinesun  初中二年级 发表于 2016-2-13 23:40:41 | 显示全部楼层 来自: 北京海淀
近在身边的爱 发表于 2016-2-13 17:27
全基因检测就是把整个基因,包括外显子、内含子及基因上下游都检测了。而外显子是基因最关键的部分。现在如 ...

谢谢您的解答。是不是可以理解为肺癌想查查有没有突变、扩增什么的,以便确定吃什么靶向药,就只需要全外显子测序就能解决了? 全基因检测对确定吃什么靶向药是否有显著优势?谢谢了。
近在身边的爱  小学六年级 发表于 2016-2-14 11:59:10 | 显示全部楼层 来自: 上海
如果用第二代测序技术,其实都是全基因测序的,只是数据分析时,分析外显子变异比较省力省时。对于点突变而言,测外显子就够了,但是对于ALK这样断裂又融合的情况,仅仅测外显子是不够的。并且,样品送出去,前面的工作是一样的,取得的数据也是一样的,因此完全可以要求公司尽量分析全面一些,目前所有靶药的位点全部分析到才好。我的意思是全基因组测序不应该比全外显子测序贵呀,公司不应该差别对待这个,纯粹忽悠人的。
cen456  小学六年级 发表于 2016-3-30 16:42:54 | 显示全部楼层 来自: 上海
外显子测序life 、illumina等主流平台都有自己的捕获芯片 做起来较简单  
信息解读也是汗牛充栋  基本可以解决问题
全基因组测序  不是太了解  可以找人再问问  价格方面肯定是外显子测序便宜
期待肿瘤靶向的飞跃
妈妈长寿  博士二年级 发表于 2016-3-30 16:53:33 | 显示全部楼层 来自: 广东广州
还是要不断学习阿

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