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[基础知识] [文献解读]炎性乳腺癌抗HER2治疗过程中的克隆进化

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2319 0 donglei 发表于 2017-4-7 10:13:00 |

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本帖最后由 donglei 于 2017-4-7 10:13 编辑
5 f' j; B) s6 J: E9 X0 r% ?1 t7 S0 r# ~
Clonal Evolutionary Analysis during HER2 Blockade in HER2-Positive Inflammatory Breast Cancer: A Phase II Open-Label Clinical Trial of Afatinib +/- Vinorelbine     PLoS Med IF:13.585
' o) g9 n- J8 q  S' M7 Y7 a8 u
文章概述
5 O6 O' ~% ^; |
1.II期开放式临床试验:HER2阳性炎性乳腺癌患者,阿法替尼单药 vs. 阿法替尼+长春瑞滨,单药治疗前后组织样本前瞻性全外测序;
# M: H9 Q: }8 e& X3 O2.阿法替尼单药治疗临床获益率35%,阿法替尼+长春瑞滨临床获益率20%,所有患者均存在治疗相关不良反应;' F) d/ K1 p2 j* M- d* K
3.与非炎性乳腺癌相比,炎性乳腺癌基因突变率升高(TP53),新抗原增加;- M! K- o2 o1 m+ D3 z- o7 P* J! |7 y
4.治疗前后组织样本基因组变异结构具有一定稳定性,单药治疗前后克隆进化存在两种模式: branched evolution,shifting clonal structure
$ S# n5 C* c5 M( h文章亮点
: a  m8 k7 Z1 `8 @1.着眼于乳腺癌中恶性程度较高、已知信息较少的炎性乳腺癌(IBC)进行研究,一定程度上分析了非炎性乳腺癌(NIBC)与IBC之间的差异;
/ {3 }6 Z0 g3 y, n" e/ ]$ X, f8 H* q$ X; A2.EGFR、HER2双靶点抑制剂阿法替尼跨适应症应用探索;2 y- {5 V2 n# E, Y
3.临床试验+基因组分析,结合临床信息从分子水平解析IBC特征;
  B* L9 G( F& o4 P) _+ x! u1 ?/ ^# n4.治疗前后节点取样,探究IBC阿法替尼单药治疗前后克隆进化过程
1 {2 M! B6 |. b2 {( w( q! ]1.研究背景8 }  q* D0 b6 f1 p* N, p& D- U6 S
1.IBC是一种发病年龄小、高侵袭性、不良预后、高转移性的乳腺癌亚型,总体发病率约占乳腺癌的1~6%;
* }8 W+ Q% o- e5 l2.前期报道中,IBC突变频谱与NIBC相比有所不同,但整体景观仍未可知;
; V+ w; \8 k& `6 M0 e; u6 t: y3.一些临床试验中,已有证据表明阿法替尼能使转移性乳腺癌患者获益(BIBW 2992,LUX-Breast 1)。
/ ], W( L! u. |- b. @9 d2. 试验设计
& O  a+ g  }# E& v  R' s研究流程( q# {2 e# w( R7 }# W0 A
图片1.png % ]3 d4 n9 l" u, f  X/ w
1.26名患者接受阿法替尼单药治疗(Part A);疾病进展后,10名患者接受阿法替尼+长春瑞滨联合治疗(Part B)
1 t2 \. b% e7 G4 i- n2 p5 r! S+ N7 H4 V2.22名患者拥有治疗前组织样本,13名患者拥有治疗前后匹配组织样本
9 ?3 [6 w0 }6 @3. 试验结果分析6 {& F  K( g$ p: t" y9 w& z
患者临床获益比较
4 Z1 X8 v+ L1 T( m, L8 r% w 图片2.png ( R; n; e' ?" U
1.单药治疗临床获益率35%,PFS中值110.5 days;26名患者中有7名接受过曲妥珠单抗治疗,在接受与未接受群体中阿法替尼临床获益率分别为0%(0/7)、47%(9/19),PFS中值分别为64 days、151 days7 y- h4 v9 z! |/ k
2.联合治疗临床获益率20%,PFS中值106.0 days;10名患者中有4名接受过曲妥珠单抗治疗,在接受与未接受群体中阿法替尼临床获益率分别为50%(2/4)、0%(0/6)
! H1 L0 M! X6 ^# X不良反应汇总4 L7 N8 u) W/ g/ T4 U8 L
图片3.png 2 ]) t, ?6 U9 S: S  a7 ?
1.无论是单药治疗还是联合治疗,不良反应率均达到100%0 B/ }: y! `2 T$ z+ w
2.3级以上不良反应率偏高(38%、70%)
$ E2 r0 t& o" Y$ X/ P# C; @3.单药治疗过程中,最常见不良反应及3级以上均为腹泻;联合治疗过程中,最常见不良反应为中性粒细胞减少及腹泻,最常见3级以上不良反应为中性粒细胞减少) n  U9 C. q9 G: `9 a
4. HER2阳性IBC突变频谱分析1 d1 G) w: u$ Y% K! ^9 h1 ?
22名患者疗前样本突变频谱分析
2 j' x/ S: F. W3 z; [; Y 图片4.png
' D% f& v. r: T' Z1.平均突变数:134.5(30–468),最常见突变基因为TP53(86.4% ,19/22)$ h& n% S/ p+ F4 ^% \2 S3 b
2.PI3K/AKT/mTOR通路相关基因突变率较高
7 v9 l9 O2 O# q3.ERBB2扩增率并非100%,可能由于肿瘤异质性或正常组织污染造成
( D5 G+ U6 l2 W 图片5.png $ s1 N& X  I( i! E
1.GISTIC分析确定了HER2阳性IBC患者染色体上4个常见扩增区域,及12个常见缺失区域
9 \: O$ A, b0 {  E7 U0 I2.与NIBC相比,IBC非同义突变率上升,新抗原增加,TP53突变率上升
! y( D) E8 |8 D. N; J2 m5. 治疗过程中的克隆进化分析5 z1 y6 g. C8 c3 p
13对配对组织样本基因组分析) ^4 N6 r6 d  [0 H9 V
图片6.png
/ W2 X% m2 j$ o  t4 d1.疗后13组织样本平均突变数181.4 (50–505),其中79.1% ± 12.0%突变与疗前配对样本共有
6 N: i. t: \( }6 Q5 }2.治疗前后拷贝数变化也具有很强的一致性;分级群聚结果显示,肿瘤组织样本通过患者来源而并非治疗状态聚合8 d6 H( i' _% F0 U, v. s2 w9 P
两种克隆进化模式- q2 N1 D. w8 l3 e- w
图片7.png
+ Z  e% U+ J, ~' [  j2 k7 W: ET1:疗前节点样本   T2:疗后节点样本     CCF:cancer cell fraction     Clonal cluster::T1、T2 CCF均接近1.0的肿瘤细胞克隆群(图中数字1代表,其余均为Subclonal cluster)
& }" q7 s! v' o1.除主克隆外,亚克隆分别为两节点组织特有
4 _" U/ W' C9 J4 j2 @( o0 ?2.主克隆、亚克隆均为两节点组织共有,仅CCF在治疗过程中有升高或降低7 B1 K( Z& f# D' Y, V4 O5 M
6. 讨论# j- G3 Y1 s* t' I
1.阿法替尼单药或联合长春瑞滨均能使HER2阳性IBC患者获益5 @- A3 g6 i5 f9 ?9 n; M
2.HER2阳性IBC具有更高的突变及新抗原负荷,与NIBC相比,TP53突变率偏高是其显著的突变频谱特征
' o# d7 `' H% k; D# B* r
3.该研究中,治疗前后配对组织基因组分析没有发现突出的耐药性克隆,表观遗传学及微环境可能是IBC耐药性研究的未来方向" ?" l* s! @& J2 v" w: c
转自吉因加科技微信订阅号& C$ |8 C/ w1 N- l/ o" e8 e

- J2 ^  j# c; ]; T6 {& k% S4 M

20170319-文献30: Clonal Evolutionary Analysis during HER2 Blockade in HER2-Posi.pdf

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